Biosintesis, Apuntes de Bioquímica

¡Descarga Biosintesis y más Apuntes en PDF de Bioquímica solo en Docsity! REGULACION DE LA TRADUCCIÓN Transtraducción PROCARIOTAS El ribosoma parado es detectado por la existencia de un tmRNA que tiene funciones de trna y de mensajero. Es intr en el sitio aminoacil y va a solucionar el problema de rib parado se suelta la prot y se degrada el mRNA. El ribosoma se para y entra el tmRNA y esto desemboca la lib del ribosoma y la proteolisis de la proteina. Tm RNA ES DE TRANSFERENCIA PORQUE ENTRA COMO UN trna y lleva a cabo la reaccion de la peptidiltranferasa y se mete la alanina. Pero por la parte del anticodon no solo no reconoce sino que tiene una reg de mrna mensajero para sucesivos trnas el sustituye al mrna truncado tiene una pauta de lectura corta que permite que prot truncada sea añadida con alanina y luego con los sig aa esa sec es señal de proteasas para que se la carguen. Tiene una region que codifica un peptido etiqueta y esa es la secuencia que se va a meter al mensajero y se conducira asi a la degradacion de la proteina. MAL:No va un trna al principio porque no hay un codon stop. Entraran trnas pero no aparearán con nada. Para solucionarle el problema se le pondra un tmRNA esp cod en algunas bacterias. ALARMONA Pero, cuando se le acaban los aa a la bacteria le faltan aa para sint prot. La falta de aa ocasiona mediante la respuesta restrictiva que lo que hace es el la traduccion, se detecta por trnas no cargados por aa. Los trnas estan carg por aa gracias a las trna aa sintasas trna sin aa no rec por factor y no suele aparecer no cargado porque if2 no le acompaña pero si no hay aa pues van a llegar descargados. La bacteria fabrica un nucleotido extraño que sirve de alarma y produce unas respuestas repentinas que han hecho que a este nucleotido se le denomine alarmona es un nucl de guanina fosf por el 3’ y por el 5’. Son muy inestables indica que la funcion es muy rapida y transitoria. Sensor muy transitorio. Se fabr dep de la pres de trna no cargados, la celula det trna no carg cuando la conc de ellas es tal cuando empiezan a aparecer en el sitio aminoacil formandose un complejo entre EFTU y trna no cargado en el sitio aminoacil. Rel A que fabr la alarmona la fabrica justo en rib parados que tienen trnas no cargados en el sitio aminoacil y se fabrica en cualquier ribosoma parado que dep de cuantos trnas descargados haya. Cuanto mas trnas no carg, mas rib parados, mas alarmona se fabr. La alarmona desap en cuanto des trna no cargados. Alarmona hace que deje de fabr trna y mrna, se aumenta la proteolisis de las prot que tengo de mas para conseguir aa y se producen pausas en la elongacion de la rna polimerasa. REGULACION DE LA TRADUCCION EN OPERONES POLICISTRÓNICOS La cantidad de traducción en el E hay mayor señal y la A y la D son intermedios de altura. La cantidad de mensajero es uniforme. La cantidad de lecturas es 10 veces mayor en E. Hay proc de reg esp de mensajeros basados en la pauta de lectura dif pautas de lecturas se pueden diferenciar por secuencias entre ellas dentro del mensajero la prediccion seria que la secuencia shine dalgarno de E sea mejor que en la otras de la e es diez veces mejor atray rib que los de la E. PERO PARECE SER QUE ESTO NO ES ASI SEGÚN LOS AUTORES. La existencia de operones policistrónicos y la un de los rib a la sec shine dal sug una manera potencial de controlar la entrada de los rib a cada pauta de lectura. Usando la historia cis trans. Una prot se una sec cerc a shine y bloquee la entrada del rib. Sec cis no sea accesible al rib porque ella misma forma una estructura bloqueante aquí teneis varios ej. La proteina p32 es una ssb del fago t4 que infecta una bacteria, esta diseñada a unirse al dna de Simple cadena hace falta en la replicacion del fago asi que hara falta en funcion de que haya mucho dna de fago replicandose o menos. Entonces el fago ha de contr la prod de la p32 la reg es a nivel de traducción. No se traduce si no es necesaria la proteina. Si es nec es porque hay dna de simple cadena y toda se une y no sobra nada. La señal trad mas prot porque hace falta pero si sobra pk ya ha acabado se prod un ef feed back para que se bloquee su trad y no se prod mas asi que se une a su 5’ de su mens de simple cadena.$ REGULACIÓN AUTÓGENA DE LAS PROT RIBOSÓMICAS Se fabr en mens pol y han de estar coordinadas entre si hay trans de varios mens que se trad dif y para coord hay que establecer de que haya la misma cant al final de la trad de todas las prot. Si no est en exceso se ens en el rib, al sobrar no se ensambla en el ribosoma y haria feed back y se uniria a la sec de prin su mens y se pararia la trad. Cada prot int con horquilla det en el mens hay una horquilla que simula ser la misma con la que la proteina se une en el ribosoma bloquea su propia produccion y la de sus mensajeras. Esto nos da la idea de que la funcion de la proteina hace facil interaccionar con otra estr del rna. REGULACION DE ESTRUCTURA SEC EN LOS RNA M QUE ESTAN SIEMPRE PERO NO ESTA SIEMPRE LA PROT QUE INT CON ELLA, La SEC DE estr sec esta siempre. REG DE ESTR SEC DEL mRNA La estr sec dependerá de otras condiciones la temperatura es el primer factor. Termosensor está en la zona 5’ del mensajero que existen o no en funcion de la temperatura. El cambio de t hace que estr que no impedia la lectura por parte del rib cambia y se bloquee la trad. Pero el cambio de t puede producir el cambio de estr sec nec para que se de la traduccion. Este caso es el mas facil de entender. Ejemplo traduccion del factor sigma 32 nec para conocer el promotor. Sustituye al sigma 70 en ciertos casos. En t bajas el mens bloquea la trad de la prot sigma 32 cambiandose la estr sec del principio de mensajero que había, a altas t la estr sec cambia y se permite la traduccion de prot sigma 32. Termosensores estr alternativa de mrna que tiene dos alternativas ON y OFF se les llama ribointerruptores. La presencia de una molecula cuyo rec por el ribointerruptor da el cambio de on a off o de off a on. Ahí tenemos estr de rna en ausencia del metabolismo OFF en presencia de adenina es rec por u 74 u 47… de ese rnam y forma un compl esp de la adenina y eso hace que ese cambio de estr permita que pueda ser traducida y pasamos a ON. Ruta de salvamento de purinas está presente este mecanismo, aquí usa A para fabr ATP ENT los enz de bios de ATP a partir de Adenina estan bloqueados hasta que ap adenina, la presencia de adenina permite la trad de esas enzimas en el operón.